Este viejo ninja fue uno de los mayores rivales del Tercer Hokage tiempo atrás. Mientras que Sarutobi abogaba por una solución pacífica a los problemas siempre que fuera posible, Danzou optaba por la mano dura ante los enemigos. Él creó la división raíz de ANBU, cuyos miembros veían suprimida por completo su voluntad y sus sentimientos para ser más efectivos. El Tercer Hokage prohibió esta división, pero Danzou siguió trabajando en ella y entrenando a sus miembros en la clandestinidad. En la saga Shippuden ha aparecido para encargar una misión a su alumno aventajado: Sai. Tenía que engañar al equipo de Naruto para ir con ellos, llegar hasta Sasuke y matarlo. Finalmente, Sai se arrepintió de su misión y Danzou no ha tenido más remedio que aceptarlo.
Cuando Tsunade queda en coma después del ataque de Pain, Danzou es aceptado como Hokage sustito hasta que esta se recupere. Por tal razón, debe acudir a la cumbre de los 5 Kages para representar a Konoha. Una vez allí, Danzou intentó controlar a Mifune con su Sharingan pero los demás lo descubren y este debe retirarse. Sin embargo, no podrá escapar con vida porque Sasuke y Madara (Obito) dan con el. Danzou fue quien le ordeno a Itachi que acabara con el clan Uchiha para evitar que estos dieran un golpe de estado. Sasuke descubre esto y juró matar a Danzou. En su combate, Danzou atrapa a Karin y amenazo a Sasuke con que si no se rendía la mataría. Este último no le importo y atravezo a ambos con su Chidori. Cuando Danzou estaba por morir, se "auto inmolo" para que Obito no pudiera conseguir su Sharingan de Shisui.